多参数水质分析仪在使用过程中应该注意以下问题：
1、系统全密闭问题。试剂液路部分连接一定要紧固，从试剂瓶到计量泵再到反应池，否则发生试剂泄漏将直接影响测试结果。其不密闭的另一个问题是测试时由于试剂在试验中吸收空气水分，会导致滴定终点延迟。
2、取样的准确问题。在标定试剂时需要取用10mg水，尽量使用10ul取样器，这样不但准确、速度快，还能够防止水滴粘附。同样地，取用甲醇试剂、乙酯也有类似的问题，取放完毕后应注意尽量缩短反应池打开的时间。
3、 磁性搅拌速度调整。在反应池中，因为滴定试剂加入时在局部，与电极不在一处，因此搅拌速度合适以快到不形成湍流为止，这样可以快达到终点。
4、滴定速度设定应先快后慢。滴定时先快速以尽量缩短试验时间，而在接近终点时应变慢，这样可提高计量精准度。 5、当日试验完毕后，一定要排空系统中的试剂，然后用甲醇清洗干净，千万不能用水清洗系统，因为其不容易挥发，将造成下次试验时试剂标定不实。
6、水质分析仪应该远离强磁场，避免工作时电子显示跳动，出现不正常现象。手动的水质分析仪，因为必须使用玻璃自动滴定管计量试剂和甲醇溶剂，而玻璃滴定管本身因为平衡压力的关系，又必须与外界接通。
7、系统尽量密闭。手动的水质分析仪需要在吸球管路和玻璃滴定管上口加接填充干燥剂的U型管，以便减少空气水分对测试结果的干扰。在空气相对湿度大于70%的环境下，应尽量不安排水分测试。
8、在调整滴定管的滴定速度时，合适是调整到1滴/秒。滴定速度太快将导致到达终点时产生的延时误差较大;而滴定速度太慢则会延长测试的过程，上述干扰容易导致迟迟不到达终点。
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